顾名思义肠道菌群就是生活在我们肠道内的微生物群落，主要内容包括一些细菌、真菌、病毒等。这些微生物与人体之间形成了复杂而微妙的共生关系，共同维护着肠道的健康与平衡。
根据功能特征，肠道菌群可分为有益菌、有害菌和中性菌三大类。
有益菌也称之为益生菌，如双歧杆菌、乳酸杆菌等，能够合成多种维生素、参与食物消化、促进肠道蠕动，抑制有害菌的生长，分解有害、有毒物质等。；
有害菌则可能引发肠道炎症、破坏肠道屏障功能；数量一旦失控大量生长，就会引发多种疾病并产生致癌物等有害物质。
中性菌，即具有双重作用的细菌，如大肠杆菌、肠球菌等，在正常情况下对健康有益，一旦它们失控或从肠道转移到身体其他部位，就可能引发许多问题。
在肠道菌群的长期进化过程中，通过个体的适应和自然选择，菌群中不同种类之间，菌群与宿主之间，菌群、宿主与环境之间，始终处于动态平衡状态中，形成一个互相依存，相互制约的系统。
目前常用的肠道菌群检测方法包括粪便化验、活体组织检查、基因检测等。
1、粪便化验
这是检测肠道菌群最常见的方法。它通过信息提取受检者粪便物，并送至病理学研究实验室管理进行处理菌落群培养，继而可以检测粪便物中各类型菌群比例及种类。
2、活体组织检查
这是一种侵入性检查，但准确率相对较高。医务人员会配合肠镜检查，并在结肠末端、直肠等部位进行活体组织取样，配合通常相关病理学培养及成分检测，观察肠内菌群比例及分布。
3、基因检测
肠道菌群也受基因遗传影响，通常对特定基因进行相关排序检测，可对肠道菌群进行初步排查诊断，并有助于后续检查及治疗方案针对性制定。
值得注意的是，在正常情况下，人体具有相对稳定的细菌群落结构，对宿主无致病性。如果肠道菌群的平衡被打破，人体就会出现腹泻、便秘、消化不良等症状。此外，肠道菌群的失衡还可能影响肠壁的屏障功能，使有害物质更容易进入血液。肠道菌群的失衡和肠道屏障的破坏与结直肠癌等疾病的发生有关，可能会进一步影响全身健康。
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